（一）上市食品超标问题依然存在。

　　尽管我国食品内在卫生质量有了明显改善，食品抽检合格率不断提高，但上市食品超标问题依然存在。目前，食品卫生平均不合格率仍达8%左右，蔬菜农药残留超标率为7％，畜产品“瘦肉精”检出率为1.2％。据对7万多家食品市场检查，发现不合格散装食品19万多公斤，病害肉40多万公斤，假冒伪劣酒类案件9.5万件。

　　（二）流通领域食品安全法律法规缺失。

　　《食品卫生法》和《产品质量法》都涉及到了食品生产和销售的卫生要求，但总的看，商品流通过程中的法律条款仍相对粗疏。目前，食品安全管理主要还是靠行政管理，亟需完善相应的法律法规。 食品很多都是鲜活产品，从生产到销售过程中保鲜、贮藏等要求较高，应有相应的法律规定。此外，市场准入是一项行之有效的办法，但这项制度的实行尚缺少上位法的支持。　　（三）食品安全标准体系不够完善。

　　而与流通有关的标准仅有100余个，相比于生产和加工标准数量差距甚大，流通过程保障食品安全的标准严重不足，即使食品生产质量合格，也难保不在流通环节出现质量安全问题。 我国有食品质量标准近3000个，从数量上看已经不少，但存在检测标准不统一，指标设置过繁，费用过高等问题，如单类有机磷的限量测定标准多达数十个，对有机磷限量的规定各不相同，造成在安全标准认定上的意见不一，如有关部门发布的无公害肉类标准需要检测的指标达三、四十个，仅“瘦肉精”一项检测定性要800元，定量分析要2000元，全部查完要一万元左右，企业难以承受。　　（四）食品流通检测及环保体系仍不健全。

　　例如，重点农产品批发市场配备的农药残留的快速检测设备，出结果最快也得30分钟左右；无公害肉类三、四十个指标全套检测完，则需要几天时间，这样的检测速度必然降低流通环节“把关”的效率。 调查显示，全国5万多家食品零售企业中建立检测中心的不足1％，全国2.6万家农贸市场配有垃圾处理设备的不足1‰；消费者对任何一类食品安全性的信任度均低于50％。此外，检测体系不健全，还表现为各部门的检测工作缺少协调，检测力量缺乏整合，检测资源不能共享，快速检测的技术手段落后。　　（五）食品安全信用体系建设亟待加强。

　　我国社会信用体系建设刚刚起步，食品安全方面的信用体系建设仍相对滞后，该领域的企业信用数据的征集工作也处在小范围尝试阶段。因此，从总体看，掌握企业食品卫生质量的信用状况难度仍然很大